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云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功
2021年01月15日 09:29:09 作者: 来源: 字号 打印 关闭

从20世纪70年代开始云南省怒江州就开始种植草果,到2020年,种植面积已达111万亩。不仅是全国草果的核心产区,也是当地群众脱贫致富的重要经济作物。

 

 

为了提高草果遗传改良效率,培育高产、抗病优质、安全新品种,对从源头创新保障草果产业健康可持续发展。

 

 

2019年9月,怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构正式启动草果全基因组测序计划,历时1年零3个月,成功完成草果全基因组测序工作,绘制了精细图谱,并于今年1月13日正式对外发布。

 

 

通过Nanopore及illumina等测序技术,拼接组装得到2.08G大小的基因组,组装出由1145个contig序列组成的草果参考基因组序列,GC含量为40.9%,最长的contig长度为31.6Mb,N50为4.7Mb。

 

 

结合HiC测序结果,得到24对染色体的高质量基因组,包括42394个基因,通过转录组、代谢组关联分析,得到草果关键香气物质合成的候选基因一批,草果全基因组精细图谱完成将极大推动草果的全基因组精准育种,为打造国家级草果种质资源圃提供重要基础作用。

撰文:刘文杰

资料:怒江州委宣传部

信息员:欧蓉

 

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